手术室的空调系统要求控制室内温度、湿度、尘埃、细菌、有害气体浓度以及气流分布，保证室内人员所需的新风量，并维持室内外合理的气流流向。其中最为重要的是控制室内细菌的浓度，以防止在手术过程中对手术伤口感染，提高手术成功率。与一般建筑物的空调要求相比，系统应该具有以下特点:
（1）空气的净化和除菌；
（2）控制各区域的气流和风速；
（3）保证不同区域之间合理的气流流向和压力分布；
（4）保证医疗上必要的温度及湿度；
（5）排出废气和有害气体，保证室内空气新鲜。良好的手术室空调系统不仅是指某个单项指标达到要求，而是全方位地实现“无菌环境保障体系”这个目的，在手术全过程中消除一切可能诱发术后感染的风险。